Vzdrževanje Vile Nautilus je primerljivo z vzdrževanjem luksuzne jahte, vendar z določenimi prednostmi zaradi izbire materialov. Sistem STIROTON uporablja materiali z visoko odpornostjo proti koroziji in vlagi, vključno s kompoziti in posebnimi premazi, ki ščitijo strukturo pred slano vodo in UV-žarki.
Ker so osnovni elementi vile monolitna in brez klasičnih spojev, se zmanjša možnost prodiranja vode ali razgradnje spojin. Prav tako, brez kovinskih delov, ki bi bili podvrženi rjavenju znotraj strukture STIROTON, kar še dodatno zmanjša potrebo po pogostih posegih.
V praksi z minimalnim letnim vzdrževanjem – vključno z pregled, pranje in obnova zaščitnih slojev – vila lahko ohrani polno funkcionalnost in estetsko vrednost desetletja.